Das Schweizer Bundesamt für Verkehr genehmigte den Bau des Abschnitts im Jahr 2020. Seit Januar 2021 ist der Beschluss bestandskräftig. In den letzten Jahren hat die Bahn bereits vorgezogene Umweltmaßnahmen umgesetzt. Die Maßnahmen zielten auf die An- und Umsiedlung seltener Reptilien und Pflanzen sowie auf die Herstellung von Korridoren zur Vernetzung der Landschaft ab. In Basel baut die Bahn insgesamt drei Brückenbauwerke. Rund zehn Kilometer Gleise werden neu verlegt und 46 Weichen eingebaut. Rund 1.450 Meter Schallschutzwände werden effektiv vor Lärm schützen.